除菌過濾器濾芯的消毒必須使用干燥飽和的高溫蒸汽消毒，且不要使用過熱的蒸汽，蒸汽必須潔凈無顆粒無污染，建議使用不銹鋼預過濾器。  

同其它消毒方法相比，高溫蒸汽消毒的優(yōu)點在于可以同時對整個過濾器系統(tǒng)中的任何部位進行消毒處理。而采用此方法的缺點在于消毒過程中會使濾芯同時承受熱應(yīng)力和機械應(yīng)力。  

除菌過濾器濾芯的消毒過程需要在121°C溫度下保持30分鐘，這樣可以殺死活動微生物。蒸汽的溫度和保持時間必須達到要求，以便能夠確保消毒完全。消毒過程必須采用純凈、飽和的高溫蒸汽（通過過濾使其精度達到1μm）；而且消毒過程中必須始終保持蒸汽的飽和性。壓力不能過大，以免除菌過濾器濾芯受到巨大壓力導致濾芯損壞。每一個濾芯使用之前都應(yīng)進行消毒處理，另外，除菌過濾器的濾芯必須完整，運輸和貯存時都需要有完整的包裝保護，而且要保存在潔凈干燥的環(huán)境中，以免濾芯收到污染。  

除菌過濾器濾芯的消毒周期:  

壓力為1.1bar，溫度為100°C飽和蒸汽條件下，濾芯最多可消毒使用120次；  

壓力為2.0bar，溫度為121°C飽和蒸汽條件下，濾芯最多可消毒使用100次；  

壓力為4.0bar，溫度為138°C飽和蒸汽條件下，濾芯最多可消毒使用50次；